Bežné metódy ochrany aminokyselín

1. Cbz
Aminoskupina chránená benzyloxykarbonylom (Cbz).
Deprotekcia N-benzyloxykarbonylu (Cbz)
Bežne používané činidlá - CbzCl

2. Alloc
Aminoskupina chránená alyloxykarbonylom (Alloc).

3. Trifluóracetyl
Trifluóracetylom chránená aminoskupina

4. Benzyly
p-metoxybenzyl (PMB) chránená aminoskupina
2,4-dimetoxybenzyl chránená aminoskupina
Aminoskupina chránená benzylovou skupinou
Deprotekcia benzyl-chránenej aminoskupiny
Debenzylácia N-Bn chlórformiátovou metódou

5. Pht (ftaloyl)
Ftaloyl (Pht) chránené aminoskupiny
Deprotekcia ftaloyl-chránenej aminoskupiny

6. Benzénsulfonyl
Nitrobenzénsulfonylová chránená aminoskupina
p-toluénsulfonylová (Tos) amino ochrana

7. Trt
Tritylová chránená aminoskupina
Deprotekcia trityl-chránenej aminoskupiny

8. Boc
Terc-butoxykarbonylom chránená aminoskupina
Deprotekcia N-terc-butoxykarbonylu
Oxalyl Chloride De-Boc

9. Fmoc
Wat metoxykarbonylom chránená aminoskupina
Bežne používané činidlá - Fmoc-Cl

10. SEM
SEM chránená aminoskupina

11. Ostatné
Acetamidom chránená aminoskupina
Reakcia syntézy Clauson-Kaasovho pyrolu (túto reakciu možno použiť ako metódu na ochranu aminoskupín, môže nahradiť dvojitú ochranu Boc a je stabilnejšia)
Bežne používané činidlá - benzyl (chlórmetyl) éter
Bežne používané činidlá – (chlórmetyl)metyléter [MOMCl]
Karbamátová ochrana